يشمل الهيكل التنظيمي الوقتي لشركة تونس للشبكة الحديدية السريعة  ثلاث أقطاب وهي:  قطب الهندسة المدنية, قطب التجهيزات وقطب الشؤون الادارية و المالية و القانونية إضافة إلى وحدات المساندة.